AYTEN YAZGAN KARATAŞ

Doç. Dr.

İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü

34469 Maslak-İstanbul

Tel: 212-285 3301 Fax: 212-285 6386

e-posta: karatasay@itu.edu.tr

Akademik dereceler ve çalışma deneyimi

Doç. Dr. - İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü , İstanbul (2008-

Yrd Doç. Dr. - İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü , İstanbul (2002-2008)

Doktora Sonrası Araştırma Asistanı - O.D.T.Ü. Biyoloji Bölümü,  Ankara (2001-2002)

Araştırma görevlisi - O.D.T.Ü., Biyoloji Bölümü, Ankara (1993-2001)

Doktora -  Biyoteknoloji Bölümü, O.D.T.Ü.., Ankara (2000)

Yüksek Lisans -  Biyoteknoloji Bölümü, O.D.T.Ü., Ankara (1993)

Lisans -  Biyoloji  Bölümü, O.D.T.Ü., Ankara (1991)

İlgi alanları

·         B. subtilis `te dipeptid antibiyotik biyosentezinin molekuler biyolojisi ve genetigi

·         B. subtilis `te sporulasyonla ilgili yeni bulunan genelerin izolasyonu ve karakterizasyonu

·         Bacillus subtilis' de çevre-sinyalizasyon ağları. Hücre yoğunluğu sinyaline dayanan, kompetans gelişimi, sporlanma-hücre farklılaşması ve antibiyotik üretimi  üzerindeki kontrol mekanizmalarının aydınlatılması

·         Genetic manipulasyonlar ve rekombinant expresyon sistemlerinin kurulmasi

·         Mikroorganizmalarda ağır metal akümülasyonları ve onlara karşı geliştirilen direnç mekanizmaları (metallothionein-metal bağlama proteinleri,bioleaching, bioremediation)

Yürüttüğü projeler

·         B. subtilis`de sporlanma ile ilgili yeni tanimlanan yvgW geninin yapisal ve fonksiyonel karakterizasyonu TUBITAK TBAG-2429 (104T038 2004-2006), proje yurutucusu.

·         Tn10 mutajenez metodu ile bacilysin biyosentezi ile ilgili tum genlerin belirlenmesi. ITU Arastirma Fonu projesi, (:30756 2004-2006),  proje yurutucusu.

·         b-laktam antibiyotik üreticici Streptomyces clavuligerus da aspartik asit metabolik yolunun genetik manipülasyonu.TUBİTAK-TBAG-2176 (102T061; 2002-2004), arastirici.

·         Sefamisin C ve klavulinik asit üreticisi Streptomyces clavuligerus'un aspartokinaz,aspartat semieldehit dehidrogenaz ve mezo-diaminopimelat dekarboksilaz genlerinin klonlanması, manipülasyonu ve homolog gen ifadelerinin antibiyotik biyosentezine etkileri DPT-2002K120540 (2002-2003), arastirici.

·         Hücre yoğunluğu sinyali ve bacilysin biyosentezi arasındaki bağlantının moleküler düzeyde tanımlanması TÜBİTAK-TBAG-1975 (100T098) (2001-2002), arastirici.

Yayınlar

·         Karataş-Yazgan,A., Çetin, S. and Özcengiz, G. 2003.The effects of insertional mutations in comQ, comP,srfA,spo0H,spo0A and abrB genes on bacilysin biosynthesis in Bacillus subtilis. Biochimica et Biophysica Acta -Gene Structure and Expression (BBA-Gene Struct. Expr.)1626: 51-56.

·         Işıl Tüzün, Ayten Y. Karataş, Özge Şeşenoğlu, Ayhan S. Demir and Gülay Özcengiz.2003. 2-Amino-N-(2-furylmethyl)propanamide as a novel alanylglycine equivalent synthesized by bacilysin synthetase. Enzyme and Microbial Technology. 33 (5-8): 725-728

·         Yazgan, A., Özcengiz, G., and Marahiel, M. A. 2001. Tn10 insertional mutations of Bacillus subtilis that block the biosynthesis of bacilysin. Biochimica et Biophysica Acta -Gene Structure and Expression (BBA-Gene struct. Expr.)1518:87-94.

·         Yazgan, A., Özcengiz, G., Özcengiz, E., Marahiel, M. A., Kılınç, K. and Alaeddinoğlu, N. G. 2001.Bacilysin biyosynthesis by a partially purified enzyme fraction from B. subtilis  Enzyme and Microbial Technology (Enzyme Microb. Tech.) 29:400-406

·         Yıldırmak, T., Yazgan A and Özcengiz, G. 1998. Multiple drug resistance patterns and plasmid profiles of non-typhi Salmonellae in Turkey. Epidemiology and Infection (Epidemiol. Infect) 121:303-330.

·         Yazgan, A. and Özcengiz, G. 1994. Subcellular distribution of accumulated heavy metals in Saccharomyces cerevisiae and Kluyveromyces marxianus. Biotechnology Letters (Biotechnol. Lett.) 16:871-874.

·         Yazgan, A., Özcengiz, G. and Alaeddinoğlu, N. G. 1993. Studies on metal-resistance system in Kluyveromyces marxianus. Biological Trace Element Research (Biol. Trace Elem. Res.) 38:117-127.

Verilen dersler

·         MBG523E  Advanced Molecular Biology

·         MBG622E  Microbial Genetics

·         MBG527E  Advanced Molecular Genetics

·         MBG 520E Advanced Molecular Biotechnology

·         BIO342E  Enzymology

·         BIO411  Molekuler Biyoloji

·         BIO412E Recombinant DNA Technology 

·         BIO111 Genel Biyoloji